Молекулярная диагностика кишечных паразитарных заболеваний – гельминты

Общая информация 

Желудочно-кишечные инфекции представляют собой группу состояний вирусной, бактериальной или паразитарной этиологии, которые чаще всего проявляются как диарейные заболевания. Они передаются преимущественно фекально-оральным путем, и им способствует отсутствие санитарии и плохая личная гигиена, что оказывает гораздо большее влияние на развивающиеся страны. Наиболее распространенными этиологическими агентами диарейного заболевания, о которых сообщается во всем мире, являются ротавирус и кишечная палочка (E. coli), но распространенность этиологии значительно различается в зависимости от локализации, возрастных групп, социально-экономического статуса и т. д. 1.

Диагностика желудочно – кишечной инфекции важна, потому что симптоматика (диарея-жидкий стул, рвота, потоотделение) может иметь серьезные краткосрочные последствия (истощение воды и электролитов в организме) с потенциально смертельным развитием, если не вмешиваться в восстановление гидроэлектролитического баланса. По данным Центра по контролю и профилактике заболеваний (CDC), диарейные заболевания являются второй по распространенности причиной смерти среди детей в возрасте до 5 лет в мире.2.

Молекулярная диагностика этиологии желудочно-кишечных инфекций позволяет одновременно тестировать несколько классов патогенов (вирусы, бактерии, паразиты) из одного образца стула и обеспечивает быстрый результат при наблюдении за назначением правильного и целевого лекарства.

Инновационный метод мультиплексной ПЦР в реальном времени позволяет идентифицировать генетический материал (РНК или ДНК) наиболее распространенных патогенов, вовлеченных в желудочно-кишечную патологию, с чистотой, превосходящей традиционные методы, и способностью выявлять коинфекции или инфекции патогенов, которые трудно диагностировать с помощью копрокультуры или компропаразитологического микроскопического исследования.

Использование методов молекулярной биологии не исключает использования традиционных методов, поскольку после идентификации возбудителя показано использование такого метода идентификации для проверки чувствительности к противомикробным агентам (антибактериальным, противогрибковым), а также показано для проверки эволюции после лечения.

Паразиты-желудочно-кишечные патогенные гельминты

Гельминты-это паразитарные черви, вызывающие гельминтные инфекции (гельминтозы) с поражением кишечника во всех возрастных группах с важной глобальной заболеваемостью и смертностью 16.

Существует множество видов кишечных гельминтных паразитов, поражающих человека, наиболее важными из которых являются: Enterobius vermicularis (острицы), черви, которые передаются через загрязненную почву (геогельминты): Ascaris lumbricoides (круглый червь), Trichuris trichuria, Necator americanus, Ancylostoma duodenale (крючковатый червь) и Strongyloides stercoralis; Hymenolepis nana/Hymenolepsis diminuta и виды Taenia.

Гельминты, вызванные геогельминтами, являются наиболее распространенными и входят в список 17 забытых тропических состояний Всемирной организации здравоохранения (ВОЗ), с очень высокой скоростью распространения в развивающихся странах с плохими мерами общественного здравоохранения 16. Инфекция геогельминтов передается через загрязненную почву и может проявляться бессимптомно или через различные симптомы, такие как боль в животе, диарея, кровопотеря, дефицит белка, выпадение прямой кишки. В случае детей своевременная недиагностированная инфекция может вызвать проблемы физического и когнитивного развития с задержкой.

В дополнение к инфекциям, определяемым гельминтами, инфекции микроспоридиями (микроспоридиозами), такие как Enterocytozoon bieneusi/Encephalitozoon cuniculi/hellem/intestinalis, могут вызывать диарею, поражая преимущественно людей с уже ослабленным иммунитетом 17.

Рекомендации к тестированию:

• острое диарейное заболевание с кровью в стуле или без нее, спазмы и боли в животе, тошнота и рвота, лихорадка и т. д., которые не проходят при симптоматическом лечении;
• хроническое поражение желудочно-кишечного тракта;
• подозрение на пищевую токсинфекцию;
• люди с установленной желудочно-кишечной симптоматикой после госпитализации;
• пациенты с ослабленным иммунным статусом (например, ВИЧ-инфекция) с подозрением на оппортунистическую патогенную инфекцию (например, Cryptosporidium spp.).

Подготовка пациента-сбор образцов до начала любого антимикробного лечения.

Собранный образец-фекалии в жидкой транспортной среде.

Контейнер для сбора - Fecal Swab

Стабильность образца - образец фекалий, собранных в транспортной среде, стабилен 2 дня при 2-8°C и 1 месяц при -20°C.

Метод-мультиплексная ПЦР в реальном времени.

Будут проанализированы следующие патогены:

Strongyloides
Necator americanus
Аскариды
Trichuris trichuria
Enterobius vermicularis
Taenia
Ancylostoma
Гименолепис
Enterocytozoon spp/ Энцефалитозун

Интерпретация результатов, границы и помехи

Результаты теста качественно сообщаются следующим образом:

Необнаружимый
Положительно с сообщением о типе / типах патогенов, присутствующих в образце.