Page 106 - Ghidul Serviciilor Medicale Synevo, Ediția 2, Volum 1
P. 106

5  METODE DE LUCRU                    GHIDUL  SERVICIILOR  MEDICALE
                                              AL  LABORATOARELOR  SYNEVO




       FISH combină tehnicile de citogenetică cu cele moleculare  pentru a detecta secvenţe specifice de ADN
       sau ARN în celule, ţesuturi şi tumori; constă în cuplarea unor lanţuri monocatenare de acizi nucleici pe
       baza existenţei unor secvenţe complementare, cu formarea de complexe sau hibrizi. Prin hibridizarea
       acizilor  nucleici  poate  fi  determinat  gradul  de  identitate  al  secvenţelor  şi  localizarea  acestora  pe
       cromozom.  Practic, o sondă marcată fluorescent hibridizează cu secvenţa ţintă complementară,
       rezultatul cuplării fiind vizualizat în microscopie cu fluorescenţă.

       Etapele de desfăşurare a reacţiei:
          1.  fixarea specimenului pe lame de microscop (pot fi utilizate celule în metafază pregătite
              la fel ca pentru analiza clasică a cariotipului sau celule în interfază pentru care nu este
              necesară efectuarea culturii);
          2.  denaturarea ADN-ului şi hibridizarea sondei marcate fluorescent la fragmentul genomic
              omolog, utilizând o temperatură adecvată;
          3.  detectarea hibridului  fluorescent (vezi figura 5.5.3).

              FISH
              FISH
                                           … .       …. .   SecvenĠa (sonda)  )
                                           ….
                                                     …
                                                                  n
                                                                (
                                                            S
                                                                  d
                                                               n
                                                              e
                                                                   a
                                                                a
                                                                 o
                                                                 s
                                                            e
                                                             c
                                                              v
                                                               Ġ
                             m
                              o
                               z
                           C
                           Cromozom pe lamelă ă             c complementară r ă
                             o
                            r
                               o
                                    m
                                    a
                                      l
                                     e
                                 p
                                m
                                   l
                                  e
                                                              p
                                                                e
                                                                 n
                                                            o
                                                                  a
                                                              l
                                                             m
                                                               em
                                                                 t
                                                  G


                                               C


                                              T
                                                 T


                                              T  C A T G A A  m a r c a t ă  c u
                                                A
                                                            marcată cu
                                                  C


                                               G

                                                T


                                                 A

                                                    ….
                                           …. .  A A G  T A C T T … .  f fluorofor r
                                                               f
                                                             o
                                                              o
                                                            u
                                           …
                                                               o
                                                            l
                                                              r
                                                       u
                                                       r
                                                        a
                                                     e
                                                      t
                                                    D Denaturare r e
                                                     n
                                                      a
                                      a
                                  l
                                  u
                                     n
                                   a
                                    t
                                   c
                              a
                                       D
                               n
                                    e
                              LanĠ dublu catenar ADN N
                              L
                                d
                                 u
                                 b
                                       A
                               Ġ
                                      r
                       …
             …. .      …. .                    T G
             …
                                               T G
                                            C A


                    G
                   T



                T
                T  C A T G A A            T T  C A

                 C
                  A

                    C

                  T


                 G
                   A

                      …
             ….
             … .  A A G  T A C T   T …. .   H Hibridizarea cu ADN denaturat a t
                                                         a
                                                a
                                                        e
                                                    u
                                                          t
                                                  a
                                                     D
                                                       d
                                                         n
                                                          u
                                                 e
                                                      N
                                                           r
                                                 r
                                                   c
                                               d

                                             i
                                              r
                                              i
                                             b
                                                     A
                                                z
                                               i
                          a
                       e
                        n
                        a
                          r
                         u
                      D Denaturare r e
                         t
                                                      …
                      ….
                                           …
             …
             …. .     … .                  …. .       …. .
                 C
                  A

                                                   G

                    G

                   T




                                                  T

                                                 A

                                                C
                T T  C A T G A   A             T T  C A T G A A




                  T


                 G

                    C
                A
                   A


                                    A
                                     C
                                               A


                                  G


                                    T

                                                  A

                                                 T

                                                   C

                                                G



             …. .  A G  T A C T T  …. .  … . A A G  T A C T T  … .  …. . A G  T A C T T  … .
                       …
             …
                                        ….
                                            …
                                                      ….
                               ….
                               Fig. 5.5.3 Etapele reacţiei FISH
                   (Adaptare dupa www.zum.de/Faecher/Materialien/beck/bilder/fish)

       Marcarea sondelor cu fluorofori oferă rezultate cu o rezoluţie mult mai mare într-un timp mai scurt, în
       comparaţie cu folosirea în trecut a izotopilor.
       Secvenţele repetitive din proba de analizat sunt blocate prin adăugarea unor sonde scurte de ADN;
       sonda  esta  aplicată  fragmentului  de  ADN  cromozomial  de  analizat  şi  incubată  pentru  hibridizare
       timp de 12 ore. După mai multe spălări pentru îndepărtarea fragmentelor nehibridizate sau parţial
       hibridizate rezultatele sunt vizualizate şi cuantificate cu ajutorul microscopului cu fluorescenţă. Gradul
       de fluorescenţă depinde de eficienţa marcării cu fluorofori.
       Marcarea directă cu flourocromi a sondelor este utilizată pentru a detecta ţinte ADN mari deoarece
         106
   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111