Page 122 - Ghidul Serviciilor Medicale Synevo, Ediția 2, Volum 1
P. 122

5  METODE DE LUCRU                    GHIDUL  SERVICIILOR  MEDICALE
                                              AL  LABORATOARELOR  SYNEVO




          -   o matriţă ARN este adăugată amestecului de reacţie (T7 ARN polimeraza, RNAzaH, AMV
              revers  transcriptaza, dNTP, soluţie tampon cu cofactorii enzimatici Mn , Mg  );
                                                               2+
                                                                    2+
          -   primul primer se ataşează secvenţei complementare la capătul 3’ al matriţei; capătul 5’ al
              primer-ului conţine promotorul pentru T7 polimeraza;
          -   revers-transcriptaza sintetizează o copie ADN complementară (ADNc);
          -   RNAzaH distruge matriţa ARN (RNAza clivează selectiv numai ARN-ul hibridizat la ADN; nu
              distruge ARN-ul monocatenar);
          -   al doilea primer se ataşează la capătul 5’ al lanţului de ADN; rezultă o moleculă ADNc dublu
              catenară ce conţine un promoter T7 intact;
          -   polimeraza T7 transcrie fiecare catenă ADN într-o copie ARN.
       Aceste  etape  reprezintă  “faza  non-ciclică  a  amplificării  NASBA“.  În  continuare,  în  “faza  ciclică  a
       amplificării NASBA”, fiecare moleculă ARN care este antisens faţă de ţinta iniţială va ataşa cel de-al
       doilea primer şi va devini matriţă pentru revers-transcriptază (vezi figura 5.6.1.12).
       Se vor sintetiza astfel noi matriţe ADNc, care la rândul lor vor genera mai multe matriţe ARN. Se poate
       obţine după aproximativ 2 ore o amplificare de 10  ori a ţintei ARN .
                                          9
                                                     1
       Tehnica NASBA este aplicată în laboratorul nostru la detectarea ARNm pentru oncoproteinele E6/E7
       al HPV .
            4
                      5’                      3’
                   Faza aciclică  Faza aciclica  5’  Reactia de hibridizare cu Primerul 11 3’
                                    ReacĠia de hibridizare cu Primerul

                                    Revers Transcriptaza  Primer 1
                                    Revers Transcriptaza
                             ARN    Sinteza catenei complementare de ADN
                                    Sinteza catenei complemenatre de ADN
                        3’                       5’
                       5’                       3’
                         ADN       Degradarea ARN cu RNAzaH
                                                    ARN:ADN
                   Faza ciclică  Faza ciclica  Primer 2
                                     Sinteza catenei de ADN
                                                     ADN:ADN     Revers Transcriptaza


                              RNA polimeraza
                              ARN polimeraza        +   Primer 2
                             Fig. 5.6.1.12 Etapele reacţiei NASBA

       III. Amplificarea izotermă SDA
       Este o metodă de amplificare a ţintei care poate fi utilizată pentru detectarea unor nivele reduse de
       secvenţe specifice ADN sau ARN.
       În prezent reacţiile SDA se desfăşoară în 2 etape: generarea ţintei şi amplificarea exponenţială a
       ţintei. În etapa de generare a ţintei matriţa de ADN dublu-catenar este denaturată şi hibridizată la două
       perechi de primeri diferiţi, denumiţi primeri de amplificare şi primeri „tampon”. Primerii de amplificare


         122
   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127